行政机关以涉及商业秘密为由不予公开政府信息，需要满足法定条件，否则可能不合法。根据《中华人民共和国政府信息公开条例》第十五条，涉及商业秘密、个人隐私等公开会对第三方合法权益造成损害的政府信息，行政机关不得公开。但是，第三方同意公开或者行政机关认为不公开可能对公共利益造成重大影响的，可以予以公开。如果行政机关决定不予公开，应当书面说明理由（条例第三十六条）。您的应对措施包括：1. 要求行政机关书面说明不予公开的理由以及该信息被认定为商业秘密的依据。2. 如果认为理由不成立，可以向该行政机关的上级主管部门或同级政府信息公开工作主管部门提出异议、举报。3. 依法申请行政复议或提起行政诉讼。复议和诉讼中，行政机关需要对其不予公开决定的合法性（包括是否确属商业秘密、是否进行了利益衡量等）承担举证责任。